El proceso de cristalización viene causado por sustancias químicas especiales que reaccionan con calcio y aluminio por el cual se producen cristales insolubles. En cuanto una superficie de hormigón aditivada con PENETRON entre en contacto con agua, reaccionarán los componentes activos del PENETRON con sus respectivos iones contenidos en el hormigón. A consecuencia de esto se crearán cristales insolubles los cuales rellenarán las grietas, poros y huecos hasta un ancho de 400 µ.
La cristalización continúa formándose hasta la profundidad de los capilares de la estructura del hormigón llegando a la parte más interna.

La complejidad de la reacción que tiene lugar aquí se entendería de la siguiente manera:
Durante el proceso de hidratación del cemento, normalmente hasta el 25% de éste no será hidratado debido a la formación de gel de tobermorita. A medida que aumenta la distancia entre la carga libre positiva y negativa, los cristales exteriores toman una carga positiva haciendo que las moléculas de agua puedan unirse gracias a la carga bipolar de la parte exterior del agua de modo que el volumen de los cristales aumente hasta conseguir una masa significativa. El alcance y la duración del crecimiento cristalino depende principalmente de la humedad existente y de la composición del hormigón.

El alcance y la duración del crecimiento cristalino dependerá principalmente de la humedad disponible y de la composición del hormigón. Por otra parte, ésta también dependerá de las propiedades físicas del hormigón, así como la del contenido de cemento, y de su densidad capilar.

Aunque estos compuestos cristalinos se forman debido a una reactivación del  cemento y poder así bloquear el paso del agua, éstos son permeables al vapor, de tal forma que el agua que haya penetrado podrá salir en forma de vapor. Así el hormigón quedará seco.

El hormigón y los materiales prefabricados quedarán sellados de tal forma que estos puedan resistir una presión de agua de hasta 20 bares, que es la misma que ejercería una columna de agua de 200 metros.

La cristalización, que sólo tiene lugar ante la presencia de humedad, crece de manera intensa hasta llegar a la red capilar del hormigón. Este proceso puede tener lugar tanto en la dirección de la presión del agua como en contra.

Otra de las ventajas de este sistema activo, radica en la naturaleza del mismo, ya que reacciona una y otra vez con la humedad, sellando así el hormigón para toda la vida. Puede ser que más tarde se formen grietas, que al penetrar la humedad quedarían cerradas de forma independiente.

Hablaríamos también del conocido proceso de auto-sanación.